R frá grunni, Háskóli Íslands

Höfundar efnis: Sigrún Helga Lund <sigrunhl@hi.is>, Anna Helga Jónsdóttir <ahj@hi.is> og Bjarki Þór Elvarson <bjarki.elvarsson@hafogvatn.is>.

• 1. Inngangur
  • 1.1. Um þessa bók
    • 1.1.1. Um þessa bók
      • 1.1.1.1. aðferð()
  • 1.2. Hvernig virkar R?
  • 1.3. Vinnulag í R/RStudio
    • 1.3.1. Vinnulag í R/RStudio
      • 1.3.1.1. Verkefnautanumhald í Rstudio
      • 1.3.1.2. Slökkt á Rstudio
  • 1.4. Aðferðir/skipanir/föll
    • 1.4.1. Aðferðir/skipanir/föll
      • 1.4.1.1. help()
      • 1.4.1.2. help.search()
      • 1.4.1.3. RSiteSearch()
      • 1.4.1.4. apropos()
      • 1.4.1.5. args()
  • 1.5. R sem vasareiknir
  • 1.6. R-pakkar
    • 1.6.1. R-pakkar
      • 1.6.1.1. install.packages()
  • 1.7. R á íslensku
  • 1.8. Gögn
  • 1.9. Leiksvæði fyrir R kóða
• 2. Frá tilraun til gagna
  • 2.1. Skráning gagna
  • 2.2. Innlestur gagna
    • 2.2.1. Innlestur gagna
      • 2.2.1.1. read.table()
      • 2.2.1.2. read.csv()
      • 2.2.1.3. c()
      • 2.2.1.4. seq()
      • 2.2.1.5. rep()
    • 2.2.2. Staðsetning skráa\(^\ast\)
  • 2.3. Gróft yfirlit gagna
    • 2.3.1. Gróft yfirlit gagna
      • 2.3.1.1. View()
      • 2.3.1.2. names()
      • 2.3.1.3. head()
      • 2.3.1.4. str()
      • 2.3.1.5. length()
      • 2.3.1.6. dim()
  • 2.4. Vöntun mælinga
    • 2.4.1. Vöntun mælinga
      • 2.4.1.1. is.na()
      • 2.4.1.2. na.omit()
      • 2.4.1.3. Óraunhæfum mælingum breytt í NA
  • 2.5. Ákveðin gildi valin úr gagnatöflu
    • 2.5.1. Ákveðin gildi valin úr gagnatöflu
      • 2.5.1.1. slice()
      • 2.5.1.2. filter()
      • 2.5.1.3. which()
      • 2.5.1.4. grep()
  • 2.6. Kóðun breyta
    • 2.6.1. A: Flokkabreytur skilgreindar
      • 2.6.1.1. factor()
      • 2.6.1.2. levels()
    • 2.6.2. B: Talnabreytum skipt upp í bil
      • 2.6.2.1. cut()
    • 2.6.3. C: Flokkar sameinaðir
    • 2.6.4. D: Dagsetningabreytur skilgreindar
      • 2.6.4.1. as_date()
    • 2.6.5. E: Leitað eftir textastrengjum
    • 2.6.6. F: Breytt um heiti á breytum
      • 2.6.6.1. rename()
    • 2.6.7. G: Vörpunum beitt á talnabreytur
  • 2.7. Umröðun gagna
    • 2.7.1. Umröðun gagna
      • 2.7.1.1. group_by()
      • 2.7.1.2. sort()
      • 2.7.1.3. arrange()
      • 2.7.1.4. pivot_longer()
      • 2.7.1.5. pivot_wider()
      • 2.7.1.6. merge()
  • 2.8. Fleiri skipanir fyrir kóðun breyta\(^\ast\)
    • 2.8.1. Fleiri skipanir fyrir kóðun breyta\(^\ast\)
      • 2.8.1.1. paste()
      • 2.8.1.2. sprintf()
      • 2.8.1.3. separate()
      • 2.8.1.4. substr()
  • 2.9. Fleiri skipanir fyrir sameiningu gagna\(^\ast\)
    • 2.9.1. Fleiri skipanir fyrir sameiningu gagna\(^\ast\)
      • 2.9.1.1. cbind()
      • 2.9.1.2. rbind()
  • 2.10. Leiksvæði fyrir R kóða
• 3. Myndræn framsetning
  • 3.1. ggplot()
    • 3.1.1. Algengustu gröf
      • 3.1.1.1. Punktarit
      • 3.1.1.2. Stöplarit
      • 3.1.1.3. Stuðlarit
      • 3.1.1.4. Kassarit
      • 3.1.1.5. Normaldreifingarrit
    • 3.1.2. Ásar
      • 3.1.2.1. Nöfn ása
      • 3.1.2.2. Nöfn kvarða
      • 3.1.2.3. Hök kvarða
      • 3.1.2.4. Mörk kvarða
    • 3.1.3. Litir og tákn
    • 3.1.4. Gröfum skipt upp í reiti
    • 3.1.5. Skipt um bakgrunn
    • 3.1.6. Myndir vistaðar
      • 3.1.6.1. Myndir vistaðar
  • 3.2. ggsave()
    • 3.2.1. Leiksvæði fyrir R kóða
• 4. Lýsandi tölfræði
  • 4.1. Talnabreytur
    • 4.1.1. Talnabreytur
      • 4.1.1.1. max()
      • 4.1.1.2. min()
    • 4.1.2. Miðja
      • 4.1.2.1. mean()
      • 4.1.2.2. median()
    • 4.1.3. Breytileiki
      • 4.1.3.1. var()
      • 4.1.3.2. sd()
      • 4.1.3.3. quantile()
    • 4.1.4. Samspil tveggja talnabreyta
      • 4.1.4.1. cor()
  • 4.2. Flokkabreytur
    • 4.2.1. Tíðni og hlutfall
      • 4.2.1.1. table()
      • 4.2.1.2. prop.table()
  • 4.3. Aðrar gagnlegar skipanir
    • 4.3.1. Aðrar gagnlegar skipanir
      • 4.3.1.1. round()
      • 4.3.1.2. summary()
      • 4.3.1.3. tapply()
      • 4.3.1.4. Pípurtiháttur
  • 4.4. Leiksvæði fyrir R kóða
• 5. Líkindafræðileg undirstaða
  • 5.1. Líkindareikningur
    • 5.1.1. Líkindareikningur
      • 5.1.1.1. factorial()
      • 5.1.1.2. choose()
  • 5.2. Strjálar líkindadreifingar
    • 5.2.1. Strjálar líkindadreifingar
      • 5.2.1.1. dbinom()
      • 5.2.1.2. pbinom()
      • 5.2.1.3. dpois()
      • 5.2.1.4. ppois()
  • 5.3. Samfelldar líkindadreifingar
    • 5.3.1. Samfelldar líkindadreifingar
      • 5.3.1.1. pnorm()
      • 5.3.1.2. qnorm()
      • 5.3.1.3. rnorm()
      • 5.3.1.4. pt()
      • 5.3.1.5. qt()
      • 5.3.1.6. pchisq()
      • 5.3.1.7. qt()
      • 5.3.1.8. pf()
      • 5.3.1.9. qf()
  • 5.4. Leiksvæði fyrir R kóða
• 6. Ályktunartölfræði
  • 6.1. Slembiúrtök valin
    • 6.1.1. Slembiúrtök valin
      • 6.1.1.1. sample()
  • 6.2. Endurvalsaðferð til að meta úrtaksdreifingu lýsistærðar
    • 6.2.1. Endurvalsaðferð til að meta úrtaksdreifingu lýsistærðar
      • 6.2.1.1. replicate()
  • 6.3. Öryggisbil reiknað með endurvalsaðferð
  • 6.4. Leiksvæði fyrir R kóða
• 7. Ályktanir um flokkabreytur
  • 7.1. Ályktanir um eitt hlutfall
    • 7.1.1. Ályktanir um eitt hlutfall
      • 7.1.1.1. binom.test()
  • 7.2. Ályktanir um tvö eða fleiri hlutföll
    • 7.2.1. Ályktanir um tvö eða fleiri hlutföll
      • 7.2.1.1. prop.test()
  • 7.3. Ályktanir um tengslatöflur
    • 7.3.1. Ályktanir um tengslatöflur
      • 7.3.1.1. chisq.test()
      • 7.3.1.2. fisher.test()
  • 7.4. Leiksvæði fyrir R kóða
• 8. Ályktanir um talnabreytur
  • 8.1. Ályktanir um dreifni
    • 8.1.1. Dreifni í tveimur þýðum
      • 8.1.1.1. var.test()
    • 8.1.2. Dreifni í fleiri þýðum
      • 8.1.2.1. bartlett.test()
  • 8.2. Ályktanir um meðaltöl
    • 8.2.1. Ályktanir um meðaltöl
      • 8.2.1.1. t.test()
    • 8.2.2. Ályktanir um eitt meðaltal
    • 8.2.3. Ályktanir um mismun tveggja meðaltala
    • 8.2.4. Ályktanir um mismun fleiri meðaltala
    • 8.2.5. Ályktanir um mismun meðaltala paraðra mælinga
  • 8.3. Levene próf fyrir dreifni\(^\ast\)
  • 8.4. Stikalaus próf\(^\ast\)
    • 8.4.1. Stikalaus próf\(^\ast\)
      • 8.4.1.1. wilcox.test()
  • 8.5. Leiksvæði fyrir R kóða
• 9. Einþátta fervikagreining
  • 9.1. Ályktanir um tvö eða fleiri meðaltöl
    • 9.1.1. Ályktanir um tvö eða fleiri meðaltöl
      • 9.1.1.1. aov()
      • 9.1.1.2. anova()
  • 9.2. Eftiráprófanir
    • 9.2.1. Eftiráprófanir
      • 9.2.1.1. TukeyHSD()
  • 9.3. Stikalaus próf\(^\ast\)
    • 9.3.1. Stikalaus próf\(^\ast\)
      • 9.3.1.1. kruskal.test()
  • 9.4. Fleiri en tveir þættir\(^\ast\)
  • 9.5. Leiksvæði fyrir R kóða
• 10. Línuleg aðhvarfsgreining
  • 10.1. Línulegt líkan smíðað
    • 10.1.1. Línulegt líkan smíðað
      • 10.1.1.1. lm()
  • 10.2. Öryggisbil fyrir stuðla líkansins
    • 10.2.1. Öryggisbil fyrir stuðla líkansins
      • 10.2.1.1. confint()
  • 10.3. Mátgæði líkansins könnuð
  • 10.4. Spágildi og spábil
    • 10.4.1. Spágildi og spábil
      • 10.4.1.1. predict()
  • 10.5. Próf á fylgnistuðli
  • 10.6. Strjál skýribreyta
  • 10.7. Fleiri skýribreytur\(^\ast\)
  • 10.8. Leiksvæði fyrir R kóða
• 11. Tvíkosta aðhvarfsgreining
  • 11.1. glm()
    • 11.1.1. Tvíkosta aðhvarfsgreining með samfellda skýribreytu
    • 11.1.2. Tvíkosta aðhvarfsgreining með strjála skýribreytu
    • 11.1.3. Leiksvæði fyrir R kóða
• 12. Knitr
  • 12.1. Umbrot á texta
    • 12.1.1. Markdown (.html eða .docx)
    • 12.1.2. LaTeX (.pdf)\(^\ast\)
  • 12.2. Jöfnur
  • 12.3. Klumpastillingar
  • 12.4. Leiksvæði fyrir R kóða
• 13. Endurvalsaðferðir
  • 13.1. Endurvalsaðferð (e. Bootstrap method)
    • 13.1.1. Öryggisbil reiknuð með endurvalsaðferð:
      • 13.1.1.1. Sýnidæmi
  • 13.2. Umraðanapróf (e. Permutation test)
    • 13.2.1. Tilgátupróf fyrir mismun tveggja lýsistærða reiknað með endurvalsaðferð:
      • 13.2.1.1. Sýnidæmi

Viðaukar

• Orðalistar
  • Íslenskur-Enskur orðalisti
  • Enskur-íslenskur orðalisti
• Um höfunda
  • Anna Helga Jónsdóttir
  • Sigrún Helga Lund
  • Bjarki Þór Elvarsson
• Um R leiksvæði
  • Leiksvæðin eru öflug
  • DataCamp
  • Vandamál með keyrslu